Преемственность микке, духовного учения нин-дзя, по отношению к сюгэндо определила комплекс практических методов и средств, которыми невидимые воины пользовались для повышения уровня психофизического состояния. Здесь просматривается влияние доктрин тантрического буддизма, даосской йоги, смешанных с шаманскими элементами синтоизма. 

СИНТО - «Путь богов» - представлял собой традиционный японский культ природных божеств, духов умерших предков. Во главе божественного пантеона синтоизма находилось высшее божество Аматэрасу и ее потомок Дзимму. 

«Горные воины», ямабуси, исповедовали культ мистических горных существ-духов - ками. 

Основной целью культа синто являлось познание и овладение силами природы с помощью духов. В основе практики лежали медитация, ритуальные жертвоприношения, произнесение магических заклинаний и т.п. Горные отшельники, проповедовавшие идеи синто, призывали своих последователей поклоняться горным духам с помощью огня и воды (яп. хакудо). 

Путь огня - это было хождение босиком по углям ритуальных костров с чтением соответствующих заклинаний. Костры разжигались из особых пород дерева в местах обитания духов. Практикующий привлекал через пламя костра силу духов гор и с чтением священных заклинаний впитывал ее в себя. Путь воды предусматривал стояние под напором падающей воды. Стоя под ледяным потоком водопада, адепт достигал определенных психофизических состояний, которые позволяли ему избежать смерти от переохлаждения. 

Другим проявлением пути воды было купание в проруби при минусовой температуре. Во время длительного стояния в ледяной воде практикующий отождествлял себя с огнем, овладевал его силой. Практика этих жестоких методов требовала знания и использования мистических аспектов, секретами которых владели продвинутые последователи. 

Учение тантрического буддизма было создано в Индии, оттуда оно попало в Китай и Тибет, где и получило дальнейшее развитие. В начале IX века в горных моностырях Тибета была создана тантрическая секта Сингон "Божественное слово"). Основателем ее принято считать легендарного монаха Кукая, выходца из Японии. Споиощью Кукая идеи Синогон проникли на его родину, где получили широкое признание у ямвбуси, а затем у ниндзя.

Тантристы пологали, что Вселенная - это тело, речь и мысли "Будды Великого Солнца" - Дайнити, и они состовляют великое триединство - санмитсу. 

Целью адапта является полное постижение санмитсу и слияние с Дайнити.

Поскольку человек есть проявление, частица безграничной Вселенной, то в нем содержатся элементы санмитсу. Проявив их в себе с помощью великих таинств и осознав эти элементы, посвященный может достич единения с космическими силами, слиться с силами Буддой. На практике это давало фантастические возможности достижения могущества во всех аспектах бытия. К этому и стремились вездесущие ниндзя.